Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scnn1bQ9WU38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scnn1bQ9WU38 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms