Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TapbpQ9R233 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms