Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sorbs3Q9R1Z8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sorbs3Q9R1Z8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms