Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx6Q9R1R0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms