Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slit2Q9R1B9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slit2Q9R1B9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slit2Q9R1B9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms