Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek3Q9R0A5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek3Q9R0A5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek3Q9R0A5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek3Q9R0A5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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