Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms