Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col4a3Q9QZS0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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