Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc4Q9QZD4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms