Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmeff2Q9QYM9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms