Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip4Q9QXN3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip4Q9QXN3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms