Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copg2Q9QXK3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg2Q9QXK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms