Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChmQ9QXG2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms