Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptf1aQ9QX98 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptf1aQ9QX98 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptf1aQ9QX98 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptf1aQ9QX98 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptf1aQ9QX98 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptf1aQ9QX98 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptf1aQ9QX98 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptf1aQ9QX98 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms