Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer2Q9QWW1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Homer2Q9QWW1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms