Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rai2Q9QVY8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rai2Q9QVY8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms