Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr4Q9QUK6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr4Q9QUK6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms