Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PolkQ9QUG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PolkQ9QUG2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms