Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csnk1eQ9JMK2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms