Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms