Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp1Q9JLK7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cabp1Q9JLK7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cabp1Q9JLK7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms