Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms