Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prg3Q9JL95 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prg3Q9JL95 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms