Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gde1Q9JL56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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Gde1Q9JL56 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gde1Q9JL56 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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