Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms