Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nova1Q9JKN6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nova1Q9JKN6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms