Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AtrQ9JKK8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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AtrQ9JKK8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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AtrQ9JKK8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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AtrQ9JKK8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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AtrQ9JKK8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrQ9JKK8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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