Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms