Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trem3Q9JKE1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms