Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msgn1Q9JK54 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msgn1Q9JK54 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms