Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Herpud1Q9JJK5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms