Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF2

Spag4, Sperm-associated antigen 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag4Q9JJF2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag4Q9JJF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spag4Q9JJF2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms