Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc86Q9JJ89 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms