Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms