Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6l2Q9JIM3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6l2Q9JIM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms