Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod3Q9JHJ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod3Q9JHJ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms