Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn12Q9ET43 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms