Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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