Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rb1cc1Q9ESK9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms