Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LrbaQ9ESE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms