Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ube3bQ9ES34 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3bQ9ES34 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms