Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SelenofQ9ERR7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms