Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim54Q9ERP3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim54Q9ERP3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim54Q9ERP3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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