Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrnb2Q9ERK7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms