Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snap29Q9ERB0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snap29Q9ERB0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms