Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ropn1lQ9EQ00 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms