Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3fQ9DCH4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms