Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx6Q9DBY5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms