Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syvn1Q9DBY1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Syvn1Q9DBY1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syvn1Q9DBY1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syvn1Q9DBY1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syvn1Q9DBY1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syvn1Q9DBY1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syvn1Q9DBY1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syvn1Q9DBY1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms