Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmbim4Q9DA39 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmbim4Q9DA39 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms